Akatsuki

Az Akatsuki egy bűnözői szervezet, ami 'S' rangú ninjákból áll, akik elhagyták falujukat, mert már saját falujukban is üldözik. Az Akatsuki tagjai nem egy nagy csapatban hanem egyedül vagy kettesével dologznak. Faluról falura járnak, hogy megkeressék a cspatakora kijelölt Jinchuuriki-t. De mielőtt ezt megtudnák valósítani, pénzt kell szerezniük. Tehát először is fő feladatnak ezt kapták. Miután a pénz megvan háborúkat robbantanak ki kisebb falukban, úgy, hogy démonokat küldenek a falukba, hogy pusztítsanak, majd az Akaustuki megjelenik, és pénzért segítenek a falunak. De igazából a háttérben ők irányítják a démonokat. Ilyen harcok során akarnak a világhatalomra jutni.

A démonok eltávolítása persze nem könnyű, hiszen azokat bizonyos emberekbe zártak be. Ezt egy ideig a barlangjukban végezték el, ami a Folyó országban van. Ebben a barlangban van egy szobor, a Pokol király szobra, ami egy fejből és két kézből áll. A démonba zárt testet elrabolják, és egy speciális technikával kiszívják a testből a démont, majd a szoborba zárják be. A szobor fején annyi szem van, ahány démon van, annyi szem van nyitva a szobron, amennyi démont már bezártak. Ha a démon kiszívásának végeztével kinyílik a szem.
Mikor Gaara-t, a Homok falu Kazekage-ját elrabolták, a Homok démon miatt, Naruto és Lee csapata indult a megmentésére. Sakura, Chiyo harcolt ebben a barlangban az Akatsuki egyik tagja ellen, Sasori ellen. Ebben a küzdelemben a barlang megsemmisült.

Az Akatsuki tagjai ruházata ugyanolyan: mindenki egy fekete ruhát hord, amin piros felhők vannak, általában mindenki hordja a szalma kalapot, amivel arcukat takarják el, és minden egyes tagnak van gyűrűje, egyedi jellel.

Pain

Pain az Akatsuki vezére, ő alapította meg a szervezetet. Az Esőrejtek faluban nevelkedett, de egy háború miatt el kellett menekülnie őneki és még két barátjának. Jiraiya találta meg őket és szűrnyai alá vette a három gyereket. Gyűrűje a Rei-t (nulla) jelképezi. Pain-t a többi tag sose nevezi őt nevén, egyszerűen csak Főnöknek, és amit mond Pain, a többiek szó nélkül megcsinálják azt. Ha Pain gyűlést akar összehívni, nem kell ahhoz konkrétan egy helyre gyűlniük, mert mindenki igen messze van a másiktól, ezért telepátiával tárgyalják meg a dolgokat.

Uchiha Itachi

Itachi Sasuke bátyja. Itachi lemészárolta egész klánját, majd elment a Levélrejtek faluból és csatlakozott az Akatsuki-hoz. Gyűrűje a Shu-t (skarlát) jelképezi. Társával, Kisame-val azt a feladatot kapták, hogy ők kapják el a Kilencfrakú rókát, ami Naruto testében van benne.

Hoshigake Kisame

Kisame Itachi társa, feladatuk a Kilencfarkú elkapása. Kisame a Ködrejtek faluból menekült el, majd ő is csatlakozott az Akatsuki-hoz. Gyűrűje a Minami-t (dél) jelképezi. Kinézetre Kisame leginkább egy cápára emlékeztet, fegyere hasonlít Zabuza kardjára, de Kisame kardja képes Csakrát elszívni az ellenféltől.

Deidara

A Kőrejtek faluból jött. Gyűrűjét jobb kezén hordja, ami a Sei-t (kékeszöld ) jelképezi. Deidara partnere Sasori, aki miután meghalt, Tobi lett a társa. Tenyerében szájak vannak, amikből képes bármit gyártani, életre kelteni, majd felrobbantja. Általában állatokat szokott gyártani. Ő és Sasori volt az, aki elrabolta Gaara-t és eltávolították belőle a démont. Első társára felnézett, mesterének tartotta. Később Gaara és Kakahsi által elveszti kezeit, de Kakuzu vissza operálta az egyiket.

Zetsu

 Hidan

 Gyűrűjét a bal kezén hordja, ami a San-t ( három ) jelképezi. Hidan vallása eléggé más, mint a többieké. A káoszt, a halált és a fájdalmat szereti. Azt mondják róla, hogy halhatatlan, hisz egyszer még a lefejezését is túlélte. Asuma-val való küzdelmében megölte Asuma-t, és vele Shikamaru végzett.